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第一天手術(shù)切除的標(biāo)本固定在10%的中性福爾馬林溶液中。組織標(biāo)本的固定是所有后續(xù)病理檢查的基礎(chǔ)。目的是保持離體的組織不會(huì)發(fā)生腐敗以及自融，使細(xì)胞的形態(tài)得到良好的保存。手術(shù)切除的標(biāo)本固定要12小時(shí)到24個(gè)小時(shí)。第二天經(jīng)過(guò)充分固定的標(biāo)本在病理醫(yī)師和技師的配合下完成取材工作，將手術(shù)切除的標(biāo)本通過(guò)肉眼觀察，將有代表性的腫瘤組織切成2×2厘米，厚度在2~3個(gè)毫米左右的組織塊。取材后的組織塊要放入自動(dòng)脫水機(jī)進(jìn)行組織的脫水浸蠟處理。脫水和浸蠟的程序大約需要10小時(shí)。第三天脫水后的組織塊經(jīng)過(guò)石蠟包埋制作成蠟塊，再經(jīng)過(guò)切片、染色、封片等制作成病理切片。一張病理切片的制作大約需要40多個(gè)步驟。經(jīng)過(guò)這么多步驟以后切片才能交到病理醫(yī)師的手中。第四天病理醫(yī)師將制作好的病理切片放在顯微鏡下觀察，結(jié)合患者的病史臨床表現(xiàn)綜合判斷，得出最終的病理診斷。第五天病理醫(yī)師將得出結(jié)論的病理報(bào)告審核、打印、簽名，形成最終的病理報(bào)告。

腫瘤分子靶向治療是指將抗腫瘤的藥物或者是能夠殺傷腫瘤細(xì)胞的活性物質(zhì)通過(guò)其余系腫瘤細(xì)胞的特異性結(jié)合，或者使用特異性的載體運(yùn)送到腫瘤的部位，使治療效果即藥物效應(yīng)盡可能的局限在特定的腫瘤細(xì)胞組織，或者是器官內(nèi)，盡量的不影響正常的細(xì)胞組織或器官的結(jié)構(gòu)和功能，從而達(dá)到既能提高療效又能減輕毒副作用的治療的方法。靶向藥物在研發(fā)時(shí)通常是針對(duì)某些特定的腫瘤的驅(qū)動(dòng)基因而設(shè)計(jì)的，不同的靶向藥物針對(duì)不同的驅(qū)動(dòng)基因的突變，因此在應(yīng)用靶向藥物之前需要了解腫瘤的驅(qū)動(dòng)基因的突變類(lèi)型，從而選擇不同的靶向藥物。比如肺腺癌，雖然組織學(xué)類(lèi)型可能都相同，但是可能涉及不同的驅(qū)動(dòng)基因。常見(jiàn)的驅(qū)動(dòng)基因有EGFR基因或者是ALK，這兩種靶向藥物這兩種基因突變的類(lèi)型對(duì)應(yīng)的靶向藥物也是不同的。在應(yīng)用靶向藥物之前就需要了解是哪一個(gè)驅(qū)動(dòng)基因發(fā)生突變，從而選擇相應(yīng)的靶向藥物。

分子病理是常規(guī)病理與免疫組化的深入與擴(kuò)展，它是在在分子層面，也就是在細(xì)胞的DNA或者是RNA水平探查腫瘤細(xì)胞的異常狀態(tài)。常規(guī)病理注重細(xì)胞形態(tài)學(xué)的觀察，也就是腫瘤細(xì)胞是長(zhǎng)什么樣子的，與正常的細(xì)胞有什么不同。這個(gè)過(guò)程主要是在光學(xué)顯微鏡下完成的，免疫組化是蛋白質(zhì)水平的檢測(cè)也就是腫瘤細(xì)胞在蛋白質(zhì)表達(dá)方面與正常細(xì)胞有什么相同或者不相同的地方，這個(gè)主要是在免疫組化實(shí)驗(yàn)室通過(guò)實(shí)驗(yàn)得出的結(jié)論。分子病理是在腫瘤細(xì)胞的DNA或者是RNA水平探查腫瘤細(xì)胞的異常。分子檢測(cè)有多種方法，從常規(guī)病理的形態(tài)學(xué)觀察到免疫組化的蛋白質(zhì)水平的檢測(cè)，再到分子病理的檢測(cè)是人類(lèi)認(rèn)識(shí)腫瘤的發(fā)展過(guò)程。即由表及里，由現(xiàn)象到本質(zhì)的過(guò)程。隨著人類(lèi)認(rèn)識(shí)腫瘤水平的提高，分子病理在病理診斷過(guò)程中的作用也會(huì)越來(lái)越大。

病理學(xué)診斷有其他診斷手段不可比擬的優(yōu)越性。病理醫(yī)生是在顯微鏡底下做出診斷的，病理科配備的光學(xué)顯微鏡可以將切成薄片的腫瘤細(xì)胞放大40~1000倍不等。病理醫(yī)生在顯微鏡底下可以看到病變的組織以及細(xì)胞的形態(tài)。再結(jié)合免疫組化的檢查以及分子病理的結(jié)果，做綜合的判斷，最終給出一個(gè)準(zhǔn)確的病理診斷。所以病理診斷是在微觀世界的觀察，相比影像學(xué)檢查或者B超的檢查，是一個(gè)宏觀的觀察。不同的腫瘤有不同的治療方式，就不僅僅是手術(shù)這樣單純的治療手段。腫瘤的治療還需要在手術(shù)之后需要配合化療、放療、靶向治療等。這些治療的手段必須等病理診斷明確以后才能做出相應(yīng)的決策。所以病理診斷是腫瘤診斷的最終診斷，也被稱(chēng)為金標(biāo)準(zhǔn)，所有的其他的診斷比如臨床診斷，影像學(xué)診斷最終都要遵從病理診斷。

病理科常用的診斷設(shè)備有光學(xué)顯微鏡，脫水機(jī)，包埋機(jī)，染色機(jī)，打號(hào)機(jī)。最主要的設(shè)備是光學(xué)顯微鏡。通過(guò)在光學(xué)顯微鏡底下觀察病理切片最終得出診斷的結(jié)論。免疫組化切片在顯微鏡下觀察后判斷，病理科更多的設(shè)備是用在病理切片的制作過(guò)程當(dāng)中的，比如組織的脫水機(jī)。脫水機(jī)為了制片的需求，將組織當(dāng)中的水分的去除掉，為后續(xù)的染色創(chuàng)造條件。還比如包埋機(jī)，主要作用是將取材后的組織塊放在石蠟當(dāng)中制成石臘塊，以便于后續(xù)的組織切片的需求。切片機(jī)主要作用是將包埋好的石臘塊切成4微米到5個(gè)微米的薄片，貼在玻璃片上，也叫載玻片。貼到玻璃片上經(jīng)過(guò)染色之后在顯微鏡下觀察。原先的染色多數(shù)是手工染色的，現(xiàn)在有自動(dòng)化的染色機(jī)，能為病理技術(shù)員減輕很大的工作負(fù)擔(dān)。打號(hào)機(jī)用來(lái)對(duì)病人有病理編號(hào)，病理編號(hào)打印在玻璃切片和石蠟包埋塊上，區(qū)別不同的病人。免疫組化實(shí)驗(yàn)室和分子病理實(shí)驗(yàn)室需要的設(shè)備更多，比如全自動(dòng)免疫組化染色機(jī)、原位雜交儀、基因測(cè)序儀等。